Abaixo lista-se alguns dos clientes da TMAA:

- ACP Bioenergia - Alamy Cândido de Paula
Teodoro Sampaio - SP

- Alta Paulista Indústria e Comércio Ltda 
Junqueirópolis - SP

- Arcelormittal Bioenergia Ltda 
Capelinha - MG

- Damha Agronegócios Ltda 
Itapura - SP

- Destilaria Alcídia S/A 
Teodoro Sampaio - SP

- Eldorado Brasil Celulose S/A
Três Lagoas - MG

- Eucalipto Brasil S/A 
Ribas do Rio Pardo - MS

- Glencane Bioenergia S/A 
Junqueirópolis - SP

- Monsanto do Brasil Ltda 
Araçatuba - SP

- Pedra Agroindustrial S/A - Usina Ipê 
Nova Independência - SP

- Raízen Energia S/A 
Regional Araçatuba - SP
Regional Andradina - SP

- Sociedade Agrícola Santa Mercedes S/A 
Santa Mercedes - SP

- Usina Caeté S/A - Unidade Brasilândia 
Brasilândia - MS

- Usina Caeté S/A - Unidade Pauliceia 
Pauliceia - SP

- Usina Conquista do Pontal S/A - UCP 
Mirante do Paranapanema - SP

- Vale do Paraná S/A Álcool e Açúcar
Suzanópolis - SP

- Viralcool Açúcar e Álcool Ltda
Castilho/SP

- Nova Unialco Bioenergia S.A
Guararapes/SP

Além destes parceiros, a Terceiro Milênio também atende produtores (pessoa física) nas mais diversas culturas.